Şeref Ataklı, 1964 yılında Burdur’un Bucak ilçesinde doğdu. İlk ve orta öğrenimini memleketinde tamamladıktan sonra, 1986 yılında Ankara Üniversitesi Siyasal Bilgiler Fakültesi Kamu Yönetimi Bölümü’nden mezun oldu.
Kamu kariyerine 1987 yılında Emniyet Genel Müdürlüğü’nde Dernek Denetçisi olarak başlayan Ataklı, 1988 yılında Yozgat Kaymakam Adayı olarak göreve başladı. 1990-1991 yıllarında İçişleri Bakanlığı’nın görevlendirmesiyle İngiltere’ye giderek bir yıl boyunca dil eğitimi ve mesleki eğitim aldı.
Görevleri arasında Hamamözü, Doğanyol ve Gölbaşı Kaymakamlıkları; Ordu Valiliği Hukuk İşleri Müdürlüğü ve Kastamonu Vali Yardımcılığı bulunuyor. 2005 yılında Radyo ve Televizyon Üst Kurulu Genel Sekreteri olarak atanarak 2010 yılına kadar bu görevi yürüttü. Ardından İçişleri Bakanlığı Hukuk Müşaviri kadrosuna geçerek Tanık Koruma Kurulu Genel Sekreterliği görevini üstlendi.
16 Şubat 2014 tarihinde Resmî Gazete’de yayımlanan kararname ile Aksaray Valisi olarak atandı. Şeref Ataklı, evli olup bir kız ve iki erkek çocuğun babasıdır.