1972 yılında Eskişehir’de doğan Nilgün Şener, 1994’te Anadolu Üniversitesi Eğitim Fakültesi Resim-İş Eğitimi Bölümü’nden mezun olmuştur. Akademik çalışmalarına aynı üniversitenin Sosyal Bilimler Enstitüsü’nde devam ederek 1998’de Resim-İş Eğitimi alanında yüksek lisansını, 2004 yılında ise Resim alanında sanatta yeterlik eğitimini tamamlamıştır.
Meslek yaşamına Milli Eğitim Bakanlığı’na bağlı okullarda resim-iş öğretmeni olarak başlayan Şener, 1993–2003 yılları arasında ilk ve ortaöğretim düzeyinde görev yapmıştır. 2004 yılından itibaren Kocaeli Üniversitesi Değirmendere Ali Özbay Meslek Yüksekokulu’nda akademik kariyerini sürdürmeye başlamış, burada öğretim görevlisi olarak çalışmalarına devam etmektedir.
Sanat üretimini akademik çalışmalarıyla birlikte yürüten Şener, bugüne dek çok sayıda ulusal ve uluslararası karma sergiye katılmış, ayrıca bir kişisel sergi açmıştır.