Koray Çalışkan, 30 Haziran 1972’de İstanbul’da doğdu. 1991 yılında Boğaziçi Üniversitesi Siyaset Bilimi ve Uluslararası İlişkiler Bölümü’ne girerek lisans eğitimine başladı ve 1995’te mezun oldu. Aynı üniversitede yüksek lisansını 1997 yılında tamamladı. Akademik çalışmalarını yurt dışında sürdüren Çalışkan, 1997-1999 yılları arasında New York University’de siyaset bilimi alanında ikinci bir yüksek lisans yaptı.
Akademik kariyerine Boğaziçi Üniversitesi’nde devam eden Çalışkan, Siyaset Bilimi ve Uluslararası İlişkiler Bölümü’nde doçent olarak görev yaptı. Çalışma alanları arasında politik iktisat, siyasi partilerin yapısı ve Orta Doğu siyaseti öne çıkmaktadır. Doktora tezi, Middle East Studies Association tarafından sosyal bilimler alanında en iyi tezlerden biri olarak ödüllendirilmiştir.
Doktora derecesini tamamladıktan sonra küresel emtia piyasalarını ele aldığı bir kitabı Princeton University Press tarafından yayımlandı. Akademik başarılarının yanı sıra eğitim alanındaki katkılarıyla Boğaziçi Üniversitesi tarafından üstün başarı ödülüne layık görüldü.
Medya alanında da aktif olan Çalışkan; Radikal Gazetesi ve BirGün Gazetesi’nde köşe yazarlığı yaptı, Habertürk ve +1 TV’de programlar hazırlayıp sundu. Ayrıca çeşitli film projelerinde yapımcı, yönetmen ve senarist olarak da görev aldı.